Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcc4E9Q236 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcc4E9Q236 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcc4E9Q236 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms