Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdr1E9Q0B4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdr1E9Q0B4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdr1E9Q0B4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdr1E9Q0B4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdr1E9Q0B4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdr1E9Q0B4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cdr1E9Q0B4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdr1E9Q0B4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms