Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc6D3YZP9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc6D3YZP9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc6D3YZP9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms