Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20547B8JJN0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20547B8JJN0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms