Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syce3B5KM66 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Syce3B5KM66 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syce3B5KM66 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms