Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cspp1B2RX88 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cspp1B2RX88 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms