Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Usf3B2RUQ2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usf3B2RUQ2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms