Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Phf3B2RQG2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf3B2RQG2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms