Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H60cB1B213 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H60cB1B213 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H60cB1B213 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H60cB1B213 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H60cB1B213 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H60cB1B213 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms