Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms