Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpruB1AUH1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtpruB1AUH1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms