Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Spocd1B1ASB6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Spocd1B1ASB6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms