Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp36B1AQJ2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp36B1AQJ2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms