Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prss40A6H6T1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms