Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Odf2A3KGV1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms