Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms