Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Upf2A2AT37 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms