Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lgr4A2ARI4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms