Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SetxA2AKX3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SetxA2AKX3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SetxA2AKX3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms