Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn34dA2AGU5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn34dA2AGU5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms