Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp8nlA2ABX0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms