Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm884A2A9H6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm884A2A9H6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms