Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prdm16A2A935 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prdm16A2A935 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
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