Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms