Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Krt27Q9Z320 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms