Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mbd2Q9Z2E1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd2Q9Z2E1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms