Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms