Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Stk39Q9Z1W9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stk39Q9Z1W9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms