Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VarsQ9Z1Q9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VarsQ9Z1Q9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VarsQ9Z1Q9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms