Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clic1Q9Z1Q5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clic1Q9Z1Q5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms