Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Clip2Q9Z0H8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Clip2Q9Z0H8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Clip2Q9Z0H8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Clip2Q9Z0H8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Clip2Q9Z0H8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Clip2Q9Z0H8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Clip2Q9Z0H8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Clip2Q9Z0H8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Clip2Q9Z0H8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clip2Q9Z0H8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms