Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0D9

Cx3cr1, CX3C chemokine receptor 1, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cx3cr1Q9Z0D9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cx3cr1Q9Z0D9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cx3cr1Q9Z0D9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cx3cr1Q9Z0D9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cx3cr1Q9Z0D9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cx3cr1Q9Z0D9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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