Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CcsQ9WU84 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcsQ9WU84 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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