Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nrf1Q9WU00 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms