Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Skp1Q9WTX5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms