Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hic1Q9R1Y5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Hic1Q9R1Y5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hic1Q9R1Y5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms