Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T2

Sae1, SUMO-activating enzyme subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sae1Q9R1T2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sae1Q9R1T2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sae1Q9R1T2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms