Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb3Q9R1P1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb3Q9R1P1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms