Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psma4Q9R1P0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Psma4Q9R1P0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms