Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf4Q9QZS2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf4Q9QZS2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rnf4Q9QZS2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms