Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col4a3Q9QZS0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col4a3Q9QZS0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col4a3Q9QZS0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Col4a3Q9QZS0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Col4a3Q9QZS0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col4a3Q9QZS0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col4a3Q9QZS0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col4a3Q9QZS0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col4a3Q9QZS0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col4a3Q9QZS0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col4a3Q9QZS0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Col4a3Q9QZS0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col4a3Q9QZS0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col4a3Q9QZS0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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