Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clcf1Q9QZM3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms