Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copg1Q9QZE5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms