Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Phtf1Q9QZ09 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phtf1Q9QZ09 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms