Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pkp3Q9QY23 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pkp3Q9QY23 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms