Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr2e3Q9QXZ7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2e3Q9QXZ7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms