Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx8Q9QXV1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms