Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Limd1Q9QXD8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
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Limd1Q9QXD8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Limd1Q9QXD8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Limd1Q9QXD8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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