Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms