Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prg4Q9JM99 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prg4Q9JM99 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms